RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CMPK1P30085 196 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC32Q14392 662 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 GK3PQ14409 553 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 Q6ZSR6 202 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2L3Q8NG85 312 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SDCCAG3Q96C92 435 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PRO3102Q9H379 93 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 GMEB1Q9Y692 573 aa22.88■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ISM1B1AKI9 464 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TNFAIP8O95379 198 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 EML2O95834 649 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 VAC14Q08AM6 782 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TDGQ13569 410 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 RGNQ15493 299 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT80Q6KB66 452 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PTOV1Q86YD1 416 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TMBIM1Q969X1 311 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS6KA6Q9UK32 745 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.87■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PRB8 838 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 DDCP20711 480 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ALDH9A1P49189 494 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 DPH7Q9BTV6 452 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 NTN4Q9HB63 628 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF639Q9UID6 485 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS23O95084 383 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CRATP43155 626 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 VEZF1Q14119 521 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ALG11Q2TAA5 492 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TFAP2CQ92754 450 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.86■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TOR1BO14657 336 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 KDELR2P33947 212 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTM5P46439 218 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 RABIFP47224 123 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 MPEG1Q2M385 716 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CARM1Q86X55 608 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 MMP21Q8N119 569 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM47BQ8NA70 645 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ADI1Q9BV57 179 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTM2P28161 218 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SOAT1P35610 550 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 BCL6P41182 706 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 SSR2P43308 183 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 PLA2G16P53816 162 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 MERTKQ12866 999 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ADRM1Q16186 407 aa22.85■■□□□ 1.25
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms