RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL42Q9P2K6 505 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFS4O43181 175 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZWINTO95229 277 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MSX1P28360 303 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB134Q4QY38 66 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD9Q8NBP5 474 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DESI2Q9BSY9 194 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG10Q9H0Y0 220 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNN3Q9UGI6 736 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 HRH3Q9Y5N1 445 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MUA0 341 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST10O43529 356 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TOXO94900 526 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR85P60893 370 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CMPK2Q5EBM0 449 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CYHR1Q6ZMK1 362 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 RPRMLQ8N4K4 120 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS7Q9Y394 339 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GALT4O96024 378 aa25.59■■□□□ 1.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 CTBP1Q13363 440 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 NAE1Q13564 534 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 AGTRAPQ6RW13 159 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND6AQ8IWF6 608 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM156Q8N614 296 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF740Q8NDX6 193 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CD200R1Q8TD46 325 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC16BQ96JE7 1060 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TMUB1Q9BVT8 246 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SPG11Q96JI7 2443 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB6O75190 326 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 AVILO75366 819 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ALOX12P18054 663 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TPSB2P20231 275 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 IST1P53990 364 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R2AP63151 447 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PMPCAQ10713 525 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TPSAB1Q15661 275 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNG2Q16589 344 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF549Q6P9A3 640 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PALM2Q8IXS6 379 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 MED16Q9Y2X0 877 aa25.58■■□□□ 1.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 CEP104O60308 925 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 BTG2P78543 158 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SARNPP82979 210 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 CLYBLQ8N0X4 340 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB127Q9H1M4 99 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBGQ9H310 441 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC24A3Q9HC58 644 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXW2Q9UKT8 454 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF3C1Q12789 2109 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa25.56■■□□□ 1.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 LCTLQ6UWM7 567 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 QSOX2Q6ZRP7 698 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ACAD11Q709F0 780 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D19Q8N5T2 526 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52N2Q8NGI0 321 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf52Q8NHV5 167 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE10AQ9Y233 779 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN3AQ9NY46 2000 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC1A2P43004 574 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR8P51685 355 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PLGLB1Q02325 96 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FOLH1Q04609 750 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PAOXQ6QHF9 649 aa25.55■■□□□ 1.68
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