RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXK1P85037 733 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NFATC4Q14934 902 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CARD17Q5XLA6 110 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DTX3Q8N9I9 347 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RCBTB1Q8NDN9 531 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PYURFQ96I23 114 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 BIN3Q9NQY0 253 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTN3Q9P232 1028 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 C11orf98E9PRG8 122 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DLGAP1O14490 977 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RBBP9O75884 186 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLITRK5O94991 958 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 IL7P13232 177 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 MMP14P50281 582 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKXP51817 358 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SNU13P55769 128 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 HTD2P86397 168 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CRHR2Q13324 411 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SEC23AQ15436 765 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NUS1Q96E22 293 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PPK0 400 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PIP5K1CO60331 668 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMD10O75832 226 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2T5Q6IEZ7 315 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 HACD2Q6Y1H2 254 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM46DQ8NEK8 389 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2T29Q8NH02 315 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CERS4Q9HA82 394 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINA7P05543 415 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GJB1P08034 283 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC36A4Q6YBV0 504 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 MT-CO2P00403 227 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NOMO3P69849 1222 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SP3Q02447 781 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR149Q86SP6 731 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CPT1BQ92523 772 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DAG1Q14118 895 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM35AQ53FP2 167 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OR51I1Q9H343 314 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NUP205Q92621 2012 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PCSK2P16519 638 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SEMG2Q02383 582 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NADK2Q4G0N4 442 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GALNT10Q86SR1 603 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SCN2AQ99250 2005 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CPNE6O95741 557 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 S1PR1P21453 382 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKCIP41743 596 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ST3GAL3Q11203 375 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 INAVAQ3KP66 663 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXL8Q96CD0 374 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FLRT2O43155 660 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 BMP6P22004 513 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 HSD11B2P80365 405 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf21Q9H246 121 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ASTN1O14525 1302 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6C75A6NL08 312 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALT2O60909 372 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SCNN1AP37088 669 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SAMD11Q96NU1 681 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 A6NLC8 198 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RFPL1O75677 317 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OPN1SWP03999 348 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 C8BP07358 591 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PTGER3P43115 390 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 HERVK_113P63132 956 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC00471Q8N535 108 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DHDHQ9UQ10 334 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DIRAS3O95661 229 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PRPS1L1P21108 318 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms