RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 MID2Q9UJV3 735 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CDRT15L2A8MXV6 281 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ISM1B1AKI9 464 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 EFSO43281 561 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 AHSGP02765 367 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PKMP14618 531 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL4DP49703 201 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKN2DP55273 166 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ART3Q13508 389 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT4Q8N4A0 578 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR48Q8TAF3 677 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 HEXDCQ8WVB3 486 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ASZ1Q8WWH4 475 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RHOJQ9H4E5 214 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RIMS3Q9UJD0 308 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 FIS1Q9Y3D6 152 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 AP4B1Q9Y6B7 739 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RRP8O43159 456 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 AP2A2O94973 939 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V1B1P15313 513 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CLN3Q13286 438 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OOSP2Q86WS3 158 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RASGRP3Q8IV61 690 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LSMEM2Q8N112 164 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MARVELD2Q8N4S9 558 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 BMPERQ8N8U9 685 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NPAS2Q99743 824 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ULBP3Q9BZM4 244 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM60AQ9NP50 221 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 STARD5Q9NSY2 213 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CARD8Q9Y2G2 431 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZW10O43264 779 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DLX3O60479 287 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GPC4O75487 556 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RECKO95980 971 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC9A5Q14940 896 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TYSND1Q2T9J0 566 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PGAM4Q8N0Y7 254 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 IL22RA1Q8N6P7 574 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OCEL1Q9H607 264 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB26Q9HCK0 441 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LHX6Q9UPM6 363 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEB16A2A368 324 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC160A6NGH7 325 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKAR1AP10644 381 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ME2P23368 584 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CBX3Q13185 183 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LSAMPQ13449 338 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZIC1Q15915 447 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO48Q5FWF7 155 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PAOXQ6QHF9 649 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP97Q8IW35 865 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A15Q8IZD6 547 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF248Q8NDW4 579 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RDH11Q8TC12 318 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NXNL1Q96CM4 212 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC12Q96GR4 267 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PKP2Q99959 881 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF385DQ9H6B1 395 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 IL33O95760 270 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CLPTM1O96005 669 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PRB1P04280 392 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CSRP3P50461 194 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHA4P54764 986 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB2Q8N680 514 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC38A9Q8NBW4 561 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5K2Q8NHB8 316 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 Q9H521 79 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF21Q9NSA1 209 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 IL17BQ9UHF5 180 aa12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms