RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 FCGR1BQ92637 280 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 DTD2Q96FN9 168 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SGPP1Q9BX95 441 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GULP1Q9UBP9 304 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 IRAK3Q9Y616 596 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NPPBP16860 134 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 AQP1P29972 269 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 HBA1P69905 142 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ITGADQ13349 1161 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MLIPQ5VWP3 458 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RTL10Q7L3V2 364 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NDNFQ8TB73 568 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RASSF1Q9NS23 344 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OR2A25A4D2G3 310 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TNFRSF11BO00300 401 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FURINP09958 794 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CSF2RAP15509 400 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CRATP43155 626 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ATP1A4Q13733 1029 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GRIN2CQ14957 1233 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 IFI44LQ53G44 452 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC80Q76M96 950 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 P3H2Q8IVL5 708 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 COQ10AQ96MF6 247 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MTG2Q9H4K7 406 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MYNNQ9NPC7 610 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 THSD1Q9NS62 852 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FUOMA2VDF0 154 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CLDN24A6NM45 220 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 A8MVJ9 347 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RHOP08100 348 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ANXA8P13928 327 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GGT2P36268 569 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 20.2
HDAC5-211ENST00000592385 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 AHSA2Q719I0 299 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OXR1Q8N573 874 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MTERF3Q96E29 417 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SAMD11Q96NU1 681 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RNF6Q9Y252 685 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NOTCH4Q99466 2003 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PIPSLA2A3N6 862 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GPR37L1O60883 481 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LILRB5O75023 590 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FUCA1P04066 466 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ETFAP13804 333 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TEKQ02763 1124 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 DGCR6Q14129 220 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 COX20Q5RI15 118 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 UBE2FQ969M7 185 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PPCDCQ96CD2 204 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FEVQ99581 238 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TCF25Q9BQ70 676 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RFPL2O75678 378 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 C6orf47O95873 294 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ITGA2P17301 1181 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CD97P48960 835 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 BCAP31P51572 246 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PSMD7P51665 324 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms