RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CDKL1	Q00532	357 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A2	Q01362	244 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TAP2	Q03519	686 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ABR	Q12979	859 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH18	Q13634	790 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNC3	Q14003	757 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT3	Q14435	633 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DMC1	Q14565	340 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	STARD8	Q92502	1023 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NCSTN	Q92542	709 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PTER	Q96BW5	349 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR21	Q99679	349 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289		H0YAE9	185 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FBP2	O00757	339 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TOR1B	O14657	336 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	AKAP10	O43572	662 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TBL1X	O60907	577 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TMCC1	O94876	653 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SCEL	O95171	688 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PGLS	O95336	258 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	H6PD	O95479	791 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LDLR	P01130	860 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KLKB1	P03952	638 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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