RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579843.5

TRIM16-218, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 4

Gene TRIM16, Length 459 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-218ENST00000579843 NOMO3P69849 1222 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 LGALS3BPQ08380 585 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 FAPQ12884 760 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DOC2BQ14184 412 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 NSDHLQ15738 373 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 P3H1Q32P28 736 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ISM2Q6H9L7 571 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 FAM81BQ96LP2 452 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CENPOQ9BU64 300 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ASF1AQ9Y294 204 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CD8B2A6NJW9 211 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 KPNA5O15131 536 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 EPHB6O15197 1021 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 KLF4O43474 513 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 E2F6O75461 281 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 MMP2P08253 660 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DANCRP0C864 163 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 RAC2P15153 192 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SLC9A1P19634 815 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CNR1P21554 472 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ENPP1P22413 925 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CCKARP32238 428 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DNASE1L1P49184 302 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DIO3P55073 304 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 STX17P56962 302 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 OR4D2P58180 307 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DSCR9P59020 149 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 HKDC1Q2TB90 917 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 BEX5Q5H9J7 111 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 RESP18Q5W5W9 173 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 TSLPQ969D9 159 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRIM16-218ENST00000579843 TMX3Q96JJ7 454 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 DRC3Q9H069 523 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 TENM2Q9NT68 2774 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 A8MVJ9 347 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 TARM1B6A8C7 271 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 H0YGG7 62 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ICMTO60725 284 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 B4GALT2O60909 372 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 HLA-DQB2P05538 268 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 MMP8P22894 467 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PKLRP30613 574 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 UGT2B10P36537 528 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 CD79BP40259 229 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 XCR1P46094 333 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PRLHRP49683 370 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SSR4P51571 173 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 EMP3P54852 163 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 BPIFB4P59827 614 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 GALNT2Q10471 571 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 FOXL1Q12952 345 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ITGA9Q13797 1035 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PTK6Q13882 451 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 BECN1Q14457 450 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 PDK1Q15118 436 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 KCTD11Q693B1 232 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM16-218ENST00000579843 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.28□□□□□ -1.4
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