RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PDE7A	Q13946	482 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAP7	Q14244	749 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPR18	Q14330	331 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NUDT13	Q86X67	352 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PLD3	Q8IV08	490 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DEFB119	Q8N690	84 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRPV3	Q8NET8	790 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OR2T12	Q8NG77	320 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MIEF2	Q96C03	454 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HAT1	O14929	419 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GMNN	O75496	209 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GSN	P06396	782 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FURIN	P09958	794 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	JUND	P17535	347 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BCL6	P41182	706 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZIC1	Q15915	447 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OR10A6	Q8NH74	314 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PIF1	Q9H611	641 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAP3K13	O43283	966 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	B3GALT4	O96024	378 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UMPS	P11172	480 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GLYAT	Q6IB77	296 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPCDC	Q96CD2	204 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EVPLL	A8MZ36	301 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AXIN1	O15169	862 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WNT1	P04628	370 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPI	P06744	558 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARFIP1	P53367	373 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRIP10	Q15642	601 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DHRS12	A0PJE2	317 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SERPIND1	P05546	499 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GGT1	P19440	569 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAPK12	P53778	367 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MTX3	Q5HYI7	312 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PAQR7	Q86WK9	346 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NAGS	Q8N159	534 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PHF12	Q96QT6	1004 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LRRC61	Q9BV99	259 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPAST	Q9UBP0	616 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	USP22	Q9UPT9	525 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LRIT2	A6NDA9	550 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EPN2	O95208	641 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FKBP9	O95302	570 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CSF2	P04141	144 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IL3	P08700	152 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NCK1	P16333	377 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ABHD18	Q0P651	414 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TAF11	Q15544	211 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PATE1	Q8WXA2	126 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TLR4	O00206	839 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GSTA4	O15217	222 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	YY2	O15391	372 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZW10	O43264	779 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PEX1	O43933	1283 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IL10	P22301	178 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04

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