RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		17.7	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		17.7	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	AXIN1	O15169	862 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	FKTN	O75072	461 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ELFN1	P0C7U0	828 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	17.69	■□□□□ 0.42	7e-9	■□□□□ 8.8
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM60	Q495X7	471 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	GPR153	Q6NV75	609 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	OXR1	Q8N573	874 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	17.69	■□□□□ 0.42	6e-8	■■■□□ 17
RRN3-205	ENST00000563559	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	FEV	Q99581	238 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	EHD1	Q9H4M9	534 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TDP1	Q9NUW8	608 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TBX21	Q9UL17	535 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CCL16	O15467	120 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF21	O75509	655 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PRIM2	P49643	509 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	INA	Q16352	499 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2A13	Q16696	494 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC80	Q76M96	950 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD4A	Q8N468	514 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	DNASE1L2	Q92874	299 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2F	Q969M7	185 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TAMM41	Q96BW9	452 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	THSD1	Q9NS62	852 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		17.69	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TTC34	A8MYJ7	566 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD11	O00231	422 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB14	O75071	495 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BGRL	O75368	114 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf105	O95561	183 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL14	O95715	111 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH4A1	P30038	563 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TGFBR2	P37173	567 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	MMP12	P39900	470 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CCR2	P41597	374 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	MVD	P53602	400 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	NCS1	P62166	190 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	HBA1	P69905	142 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SCARB2	Q14108	478 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LAS2	Q8IYD9	372 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF480	Q8WV37	535 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	MTERF3	Q96E29	417 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	KCNC2	Q96PR1	638 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	YME1L1	Q96TA2	773 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PCM1	Q15154	2024 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CLCA1	A8K7I4	914 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	RFPL2	O75678	378 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	UGT2B10	P36537	528 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TBPL1	P62380	186 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PDE7A	Q13946	482 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM215	Q68D42	235 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LIPI	Q6XZB0	460 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP8	Q86W28	1048 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	FOXJ1	Q92949	421 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PPCDC	Q96CD2	204 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	NEURL2	Q9BR09	285 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	SPAST	Q9UBP0	616 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		17.68	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LTBP2	Q14767	1821 aa		17.67	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	GPR37L1	O60883	481 aa		17.67	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	LCK	P06239	509 aa		17.67	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		17.67	■□□□□ 0.42
RRN3-205	ENST00000563559	ETFA	P13804	333 aa		17.67	■□□□□ 0.42

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