RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551160.5

BEST3-210, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene BEST3, Length 721 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-210ENST00000551160 IQCDQ96DY2 449 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CHP1Q99653 195 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TRIM64BA6NI03 449 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 RNF212BA8MTL3 300 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 E7ENX8 843 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 KPNA5O15131 536 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 KIF5CO60282 957 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 NIPSNAP2O75323 286 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 B3GALT4O96024 378 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 IGHG3P01860 377 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 MAOAP21397 527 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 BMP5P22003 454 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ATP5DP30049 168 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 MAGEA5P43359 124 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TTPAP49638 278 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ASCL1P50553 236 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 BTG2P78543 158 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TAP2Q03519 686 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 KCNJ11Q14654 390 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 POU4F3Q15319 338 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 AADACL2Q6P093 401 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 PHC2Q8IXK0 858 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 NAXEQ8NCW5 288 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 Q96MF0 132 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 DNAJC7Q99615 494 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 GALPQ9UBC7 116 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ZANQ9Y493 2812 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 A0A1B0GVC2 190 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CLCA1A8K7I4 914 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 AQP7O14520 342 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CHST10O43529 356 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 WDR1O75083 606 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ATP6AP2O75787 350 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 EPXP11678 715 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 IL10P22301 178 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SSR4P51571 173 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 WNT3P56703 355 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CDH17Q12864 832 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 P3H1Q32P28 736 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 LINC00523Q86TU6 105 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ASPGQ86U10 573 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 P3H2Q8IVL5 708 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 LINC01560Q8TB33 94 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 ZNF592Q92610 1267 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 KIAA1191Q96A73 305 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 BIRC8Q96P09 236 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-210ENST00000551160 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms