RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TTL	Q8NG68	377 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	C19orf60	Q96EN9	201 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FUT8	Q9BYC5	575 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LUZP4	Q9P127	313 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CHST10	O43529	356 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RDH16	O75452	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	WFS1	O76024	890 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	WDR47	O94967	919 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FH	P07954	510 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ITGAM	P11215	1152 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	JAK1	P23458	1154 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CRABP2	P29373	138 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GDF5	P43026	501 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TNFSF10	P50591	281 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	OR4D1	Q15615	310 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DEFB134	Q4QY38	66 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ISCA2	Q86U28	154 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SHISA5	Q8N114	240 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MMP25	Q9NPA2	562 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LRIT2	A6NDA9	550 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CLEC3A	O75596	197 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	STK16	O75716	305 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CASP2	P42575	452 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	KCNC1	P48547	511 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SLC7A5	Q01650	507 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NSDHL	Q15738	373 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TBCC	Q15814	346 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	INA	Q16352	499 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	EXT1	Q16394	746 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FHL5	Q5TD97	284 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FAR1	Q8WVX9	515 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	AICDA	Q9GZX7	198 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RHBG	Q9H310	441 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	HMX2	A2RU54	273 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	OR2W5	A6NFC9	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	WIPF3	A6NGB9	483 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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