RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0G2JND7	137 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CPED1	A4D0V7	1026 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CAPN14	A8MX76	684 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379		H0YGG7	62 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379		H0YIG0	161 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	UBD	O15205	165 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GUCY1B2	O75343	617 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NPPA	P01160	153 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HBQ1	P09105	142 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LINC00032	P0C843	101 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DRD2	P14416	443 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PRPS1L1	P21108	318 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	EPHA3	P29320	983 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SERPINB3	P29508	390 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RORA	P35398	523 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ARSF	P54793	590 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GFER	P55789	205 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MC2R	Q01718	297 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	BIK	Q13323	160 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PDE7A	Q13946	482 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SPIDR	Q14159	915 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GRM7	Q14831	915 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	KRT72	Q14CN4	511 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CEBPE	Q15744	281 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC6	Q16204	474 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NDUFA9	Q16795	377 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MUM1	Q2TAK8	710 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	IRGC	Q6NXR0	463 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ABHD13	Q7L211	337 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	BMPER	Q8N8U9	685 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	OR52B2	Q96RD2	323 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	AICDA	Q9GZX7	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LYRM4	Q9HD34	91 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MYNN	Q9NPC7	610 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ACSS2	Q9NR19	701 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ADAMTS20	P59510	1910 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0A6YYD5	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PLPP1	O14494	284 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FFAR3	O14843	346 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GPR42	O15529	346 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	KLHL18	O94889	574 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ETHE1	O95571	254 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	KIT	P10721	976 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	BCKDHA	P12694	445 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ALOX12	P18054	663 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GPX3	P22352	226 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24

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