RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 KITP10721 976 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PRPH2P23942 346 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RAP1GDS1P52306 607 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 LRRC34Q8IZ02 419 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 OR2L5Q8NG80 312 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RGMAQ96B86 450 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 C19orf60Q96EN9 201 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PISDQ9UG56 409 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PIP5K1BO14986 540 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 P2RX6O15547 441 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MAPK10P53779 464 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HYAL2Q12891 473 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HKDC1Q2TB90 917 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MS4A6EQ96DS6 147 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PPP3R2Q96LZ3 170 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 QRFPRQ96P65 431 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 KCNC2Q96PR1 638 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TUBB1Q9H4B7 451 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SYNPO2LQ9H987 977 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ADAM21Q9UKJ8 722 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CDC14AQ9UNH5 594 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SATB2Q9UPW6 733 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.46■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SCRG1O75711 98 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ALOX12P18054 663 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 BTKQ06187 659 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 SPIN4Q56A73 249 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 PAGE2Q7Z2X7 111 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 KCT2Q8NC54 265 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 STON2Q8WXE9 905 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ACPTQ9BZG2 426 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 OR51B5Q9H339 312 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 MEAF6Q9HAF1 191 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ANKHQ9HCJ1 492 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 CUTCQ9NTM9 273 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.45■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 GMNCA6NCL1 334 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ZNF749O43361 778 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ERI3O43414 337 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 LINC00032P0C843 101 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 SMIM10L1P0DMW3 83 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ITIH1P19827 911 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 SMU1Q2TAY7 513 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 AP5B1Q2VPB7 878 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 XKR7Q5GH72 579 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 RHBDD2Q6NTF9 364 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 PRMT9Q6P2P2 845 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 IGF2-ASQ6U949 168 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 SCIMPQ6UWF3 145 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 PROKR1Q8TCW9 393 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 SMIM10Q96HG1 83 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 F2RL3Q96RI0 385 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 NUF2Q9BZD4 464 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 APMAPQ9HDC9 416 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 STARD5Q9NSY2 213 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ADAM29Q9UKF5 820 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 TMED5Q9Y3A6 229 aa24.44■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 FAM149AA5PLN7 773 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 AGRPO00253 132 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 DSCR3O14972 297 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 PCSK2P16519 638 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 GCGRP47871 477 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 AVPR1BP47901 424 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 NR6A1Q15406 480 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 SPDYAQ5MJ70 313 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 Q6ZSR9 355 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 METTL4Q8N3J2 472 aa24.43■■□□□ 1.5
STIP1-208ENST00000540501 RNF175Q8N4F7 328 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms