RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 OLR1P78380 273 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 C4orf17Q53FE4 359 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SFT2D3Q587I9 215 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PDSS2Q86YH6 399 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CYP4X1Q8N118 509 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 AMER2Q8N7J2 671 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TRPV3Q8NET8 790 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FAR1Q8WVX9 515 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CCT6BQ92526 530 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 C5orf34Q96MH7 638 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CPNE1Q99829 537 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SARGQ9BW04 601 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RAB17Q9H0T7 212 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PELI2Q9HAT8 420 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 KCNK13Q9HB14 408 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ITPR2Q14571 2701 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 A1L4Q6 167 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 DNAJB6O75190 326 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 DDAH2O95865 285 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FHP07954 510 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CYC1P08574 325 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 JAK1P23458 1154 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SOX11P35716 441 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TNFSF10P50591 281 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 EFNA3P52797 238 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OR4D2P58180 307 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CDKL1Q00532 357 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CAV1Q03135 178 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TGFBIQ15582 683 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GRTP1Q5TC63 336 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-222ENST00000540445 PPM1NQ8N819 430 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 BCORP1Q8N888 145 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PLPP5Q8NEB5 264 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 NT5CQ8TCD5 201 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FAR2Q96K12 515 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OR1F2PQ96R84 312 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 LPAR4Q99677 370 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 DERL2Q9GZP9 239 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RHBGQ9H310 441 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 KLHL31Q9H511 634 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OLAHQ9NV23 265 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-222ENST00000540445 CD274Q9NZQ7 290 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ABI3Q9P2A4 366 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-222ENST00000540445 OR5H15A6NDH6 313 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 E2F3O00716 465 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CLGNO14967 610 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PRMT3O60678 531 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RASAL1O95294 804 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 LDLRP01130 860 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SERPINA6P08185 405 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GSTA2P09210 222 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 EDN3P14138 238 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GP5P40197 560 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MAGEA4P43358 317 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HSPA7P48741 367 aa8.48□□□□□ -1.05
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