RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 RCN2Q14257 317 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 IGFL3Q6UXB1 125 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 LCA5Q86VQ0 697 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.93■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 STATHP02808 62 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PCDH1Q08174 1060 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 TMEM205Q6UW68 189 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 C7orf57Q8NEG2 295 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PPCSQ9HAB8 311 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 HMX2A2RU54 273 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 UBXN8O00124 270 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 RDH16O75452 317 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 MAGEA12P43365 314 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PHEXP78562 749 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 DLG1Q12959 904 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 DEFB134Q4QY38 66 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 CCT6BQ92526 530 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 REPS1Q96D71 796 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 RIPK2O43353 540 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 UGDHO60701 494 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 SMIM24O75264 130 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 TLE1Q04724 770 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 CHIT1Q13231 466 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 SETDB1Q15047 1291 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 SYT16Q17RD7 645 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 PLPP5Q8NEB5 264 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 CENPKQ9BS16 269 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 RHBGQ9H310 441 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX3-202ENST00000539804 KLK8O60259 260 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 SERPINA7P05543 415 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 FHP07954 510 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 COX6A1P12074 109 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 RNH1P13489 461 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 NR1D1P20393 614 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 HNF4AP41235 474 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 GLRBP48167 497 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 KCNC1P48547 511 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 FOXL2P58012 376 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 DOC2AQ14183 400 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 E2F2Q14209 437 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 CRB2Q5IJ48 1285 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 LIPJQ5W064 366 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 MED27Q6P2C8 311 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 PDSS2Q86YH6 399 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 LMF1Q96S06 567 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 EPN3Q9H201 632 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 LRIT2A6NDA9 550 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 K7EM74 188 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 WFS1O76024 890 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX3-202ENST00000539804 WISP1O95388 367 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms