RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GVC2	190 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ITGA10	O75578	1167 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	IGHG3	P01860	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MAOA	P21397	527 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	UQCRC1	P31930	480 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GPR143	P51810	404 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	WNT3	P56703	355 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KEAP1	Q14145	624 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TRIL	Q7L0X0	811 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KPNA5	O15131	536 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PSMD3	O43242	534 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CCNDBP1	O95273	360 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NMBR	P28336	390 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	IMPA1	P29218	277 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ATP5D	P30049	168 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEA5	P43359	124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TTPA	P49638	278 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00523	Q86TU6	105 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	FAM222B	Q8WU58	562 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC45	Q96CN5	670 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ARID1A	O14497	2285 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557		H7C1Q1	480 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	KIF5C	O60282	957 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFS3	O75489	264 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	OR6B1	O95007	311 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ETS1	P14921	441 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms