RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		21.32	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FOXS1	O43638	330 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SPAG7	O75391	227 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MED26	O95402	600 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	F8A1	P23610	371 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	LCP2	Q13094	533 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	LIPM	Q5VYY2	423 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MOCOS	Q96EN8	888 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FAR2	Q96K12	515 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CATSPER2	Q96P56	530 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	OXSM	Q9NWU1	459 aa		21.31	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	KLHL18	O94889	574 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	IL1RN	P18510	177 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PKNOX1	P55347	436 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CDC20	Q12834	499 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRAF3	Q13114	568 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	UNC50	Q53HI1	259 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CHSY3	Q70JA7	882 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	COX15	Q7KZN9	410 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	HDX	Q7Z353	690 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	RAB43	Q86YS6	212 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF382	Q96SR6	550 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZZEF1	O43149	2961 aa		21.3	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	LRIT2	A6NDA9	550 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TYROBP	O43914	113 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	IL10	P22301	178 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CDH13	P55290	713 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	IFT88	Q13099	833 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	NKG7	Q16617	165 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	UGT8	Q16880	541 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	OR2L5	Q8NG80	312 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	NACC2	Q96BF6	587 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MIEF2	Q96C03	454 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	IP6K3	Q96PC2	410 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PRORY	Q9H606	182 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SNX6	Q9UNH7	406 aa		21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TM9SF1	O15321	606 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRIM13	O60858	407 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	IGHE	P01854	428 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	HYAL2	Q12891	473 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PCLAF	Q15004	111 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	DEFB134	Q4QY38	66 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	AMER3	Q8N944	861 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	THAP4	Q8WY91	577 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		21.28	■■□□□ 1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms