RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		A0A087WWL8	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MYO1C	O00159	1063 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KCNK1	O00180	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HCRTR1	O43613	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDC14B	O60729	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NDST3	O95803	873 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CHEK2	O96017	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC4A1	P02730	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GRP	P07492	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MYBL1	P10243	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	COX6B1	P14854	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PVR	P15151	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CAPN3	P20807	821 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MMP11	P24347	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NDUFS1	P28331	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SSTR2	P30874	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRKCI	P41743	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LMAN1	P49257	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UBXN1	Q04323	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		Q0VFX4	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NRTN	Q99748	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		M0QYG6	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCL21	O00585	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SOCS6	O14544	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KCNN4	O15554	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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