RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 GALCP54803 685 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP12-1P59990 96 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 PICALMQ13492 652 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 GCKRQ14397 625 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 HERPUD1Q15011 391 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 POSTNQ15063 836 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCNG2Q16589 344 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCL14Q16627 93 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 DUSP5Q16690 384 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 PHKG1Q16816 387 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCK2Q16822 640 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 LETM2Q2VYF4 491 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 UGT3A2Q3SY77 523 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR33Q49SQ1 333 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM106AQ4KMX7 169 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 NHSL2Q5HYW2 709 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGD3Q5JSP0 725 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM198Q66K66 360 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 C11orf63Q6NUN7 778 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDC73Q6P1J9 531 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RFWD3Q6PCD5 774 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC24A5Q71RS6 500 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 HMGN2P46Q86SG4 172 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGI2Q8N0V4 545 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 NDUFAF2Q8N183 169 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00304Q8N9R0 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5M9Q8NGP3 310 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR13F1Q8NGS4 319 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FBXO30Q8TB52 745 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 TBCKQ8TEA7 893 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 METTL21AQ8WXB1 218 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMARCE1Q969G3 411 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM149B1Q96BN6 582 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 APOPT1Q96IL0 206 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM20AQ96MK3 541 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 COL21A1Q96P44 957 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPIN2AQ99865 258 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC3Q9BQI4 270 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FNDC11Q9BVV2 318 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 GKN1Q9NS71 199 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FBXL4Q9UKA2 621 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SARDHQ9UL12 918 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CA5BQ9Y2D0 317 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 NME7Q9Y5B8 376 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CACNG2Q9Y698 323 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RTN2O75298 545 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 HPNP05981 417 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZCCHC18P0CG32 403 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMIM18P0DKX4 95 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 DLATP10515 647 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNH1P13489 461 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM11P17152 192 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 C4BPBP20851 252 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 HMGCLP35914 325 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CETN2P41208 172 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALDH3B1P43353 468 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPS10P46783 165 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC9A3P48764 834 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RARSP54136 660 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT33BQ14525 404 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAF9Q16594 264 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 KYAT1Q16773 422 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CA9Q16790 459 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00483Q53H64 154 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYT14P1Q58G82 188 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARMCX4Q5H9R4 360 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANO1Q5XXA6 986 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACSM2BQ68CK6 577 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF677Q86XU0 584 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEP57L1Q8IYX8 460 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF709Q8N972 641 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms