RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 LCP2Q13094 533 aa25.47■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 LCN10Q6JVE6 187 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 CHSY3Q70JA7 882 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 NACC2Q96BF6 587 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MOCOSQ96EN8 888 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 CMTM7Q96FZ5 175 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 CATSPER2Q96P56 530 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM111AQ96PZ2 611 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 C14orf105Q9NVL8 296 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 IL17BQ9UHF5 180 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 TRPS1Q9UHF7 1281 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 LRIT2A6NDA9 550 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MED26O95402 600 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 PCNAP12004 261 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 IL10P22301 178 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 F8A1P23610 371 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1D4P47884 311 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAF3Q13114 568 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52B6Q8NGF0 335 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa25.46■■□□□ 1.67
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 FAR2Q96K12 515 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MACROD1Q9BQ69 325 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ROGDIQ9GZN7 287 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A11Q9NSA0 550 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 PPT2Q9UMR5 302 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 MAU2Q9Y6X3 613 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-212ENST00000508338 EPG5Q9HCE0 2579 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM13O60858 407 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL18O94889 574 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 STATHP02808 62 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 FOLR3P41439 243 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ARFIP1P53367 373 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH13P55290 713 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CXADRP78310 365 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 HYAL2Q12891 473 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 COX15Q7KZN9 410 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2L5Q8NG80 312 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2Y1Q8NGV0 311 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TRPC4APQ8TEL6 797 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMOQ9BU70 441 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TGIF2Q9GZN2 237 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TMBIM4Q9HC24 238 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX6Q9UNH7 406 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZWINTO95229 277 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHEP01854 428 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SMIM10L1P0DMW3 83 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 IL1RNP18510 177 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 NAGLUP54802 743 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 IFT88Q13099 833 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4F6Q8NGB9 312 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 OR9A4Q8NGU2 314 aa25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP2-212ENST00000508338 MS4A6EQ96DS6 147 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SMIM10Q96HG1 83 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 IP6K3Q96PC2 410 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC29A3Q9BZD2 475 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CPNE5Q9HCH3 593 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TRPC4Q9UBN4 977 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH17O14917 1159 aa25.43■■□□□ 1.66
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SH3BP2-212ENST00000508338 CYC1P08574 325 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TSFMP43897 325 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF33BQ06732 778 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SSPNQ14714 243 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC9A5Q14940 896 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PCLAFQ15004 111 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 NKG7Q16617 165 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT8Q16880 541 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 FRG2Q64ET8 278 aa25.43■■□□□ 1.66
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