RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CA14Q9ULX7 337 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SUFUQ9UMX1 484 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNK6Q9Y257 313 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 VGLL3A8MV65 326 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC31A1O15431 190 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKD3O94806 890 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EPN2O95208 641 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 GLULP15104 373 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 BSGP35613 385 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NBL1P41271 181 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB28P51157 221 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CSNK1G2P78368 415 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 VMACQ2NL98 169 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 UAP1L1Q3KQV9 507 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ERICH5Q6P6B1 374 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 WASH2PQ6VEQ5 465 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 IKBIPQ70UQ0 350 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EID3Q8N140 333 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS37AQ8NEZ2 397 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A1Q8NGT9 310 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP90Q8TF47 636 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM162AQ96A26 154 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PYURFQ96I23 114 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 BMFQ96LC9 184 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TWSG1Q9GZX9 223 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 YY1AP1Q9H869 796 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TPT1P8Q9HAU6 139 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FGF22Q9HCT0 170 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FZD3Q9NPG1 666 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 AHSPQ9NZD4 102 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJB9Q9UBS3 223 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PADI4Q9UM07 663 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 V9GYQ6 96 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 POM121BA6NF01 834 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PROB1E7EW31 1015 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 H7BY64 318 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 LATO43561 262 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNDBP1O95273 360 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 APBB3O95704 486 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-ND1P03886 318 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SEMG1P04279 462 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KLK1P06870 262 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFV2P19404 249 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIBP23284 216 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MYF6P23409 242 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMB5P28074 263 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA2P43356 314 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MVDP53602 400 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MC1RQ01726 317 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf80Q0P641 193 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 VEZF1Q14119 521 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NFATC4Q14934 902 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ANGPT1Q15389 498 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZIC1Q15915 447 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RPE65Q16518 533 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC36A3Q495N2 470 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO43Q4G163 708 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EOGTQ5NDL2 527 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TPRG1LQ5T0D9 272 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXB2Q5VYV0 432 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CDC26Q8NHZ8 85 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO30Q8TB52 745 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1E3Q8WZA6 343 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D20Q96BZ9 403 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TM4SF18Q96CE8 201 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CNBD2Q96M20 576 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAP1Q96NZ9 151 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2M4Q96R27 311 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms