RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD300C	Q08708	224 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	UPP1	Q16831	310 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619		Q6ZR54	194 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	NSMAF	Q92636	917 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619		G3V2L1	256 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	INPP4B	O15327	924 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	BCL2L11	O43521	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	CTNNA2	P26232	953 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	LIMK2	P53671	638 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	SRPX	P78539	464 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	GCKR	Q14397	625 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PSMD6	Q15008	389 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPA1	Q15181	289 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A087WV48	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAGEB2	O15479	319 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPRIN2	O60269	458 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	GOT1	P17174	413 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	EDNRA	P25101	427 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	SSTR1	P30872	391 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	CLCN4	P51793	760 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNK1	Q13470	666 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	GRB14	Q14449	540 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAD54L	Q92698	747 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619		E5RGE8	158 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFSF12	O43508	249 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCG2	P13521	617 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	IFNAR1	P17181	557 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	SP140L	Q9H930	580 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	FLRT2	O43155	660 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIF5C	O60282	957 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRAF2	O60831	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NCKAP1-208	ENST00000495619	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74

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