RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	ZW10	O43264	779 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	AQP9	O43315	295 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SDC3	O75056	442 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CLDN7	O95471	211 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NDST3	O95803	873 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	EPO	P01588	193 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC4A1	P02730	911 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CSF2	P04141	144 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ANXA6	P08133	673 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NUDT17	P0C025	328 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFB7	P17568	137 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CAPN3	P20807	821 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DGKA	P23743	735 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	STX2	P32856	288 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PFN3	P60673	137 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PDE1B	Q01064	536 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	BNC1	Q01954	994 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	RALGDS	Q12967	914 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	GALNT3	Q14435	633 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ITIH4	Q14624	930 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NFATC4	Q14934	902 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CNGA3	Q16281	694 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	P3H1	Q32P28	736 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PGM2	Q96G03	612 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SNF8	Q96H20	258 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SNX22	Q96L94	193 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	HACD3	Q9P035	362 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.4	□□□□□ -1.71

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