RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDUFV2P19404 249 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARSDP51689 593 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3BP2P78314 561 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF4P78317 190 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS6KA2Q15349 733 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PFKFB4Q16877 469 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHFQ7M4L6 423 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFHBQ8N7U6 833 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SFXN2Q96NB2 322 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGMNQ99538 433 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OTOFQ9HC10 1997 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0A0MRY4 1105 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM234BA2RU67 622 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMIM30A4D0T7 59 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 A6NJY4 79 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLCA1A8K7I4 914 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 AOC2O75106 756 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC00032P0C843 101 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRKAR1AP10644 381 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNASE1P24855 282 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTGFRP43088 359 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLCN3P51790 818 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP12AP54707 1039 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRMT2P55345 433 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSNK2BP67870 215 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLDN10P78369 228 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q8N402 240 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HGDQ93099 445 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPATA13Q96N96 652 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PKMYT1Q99640 499 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCF25Q9BQ70 676 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISM1B1AKI9 464 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR4F21O95013 312 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB10P61026 200 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRHR2Q13324 411 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 OPCMLQ14982 345 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED22Q15528 200 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNA6Q15825 494 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 MICBQ29980 383 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 HECTD3Q5T447 861 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIQKQ629K1 86 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT74Q7RTS7 529 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF605Q86T29 641 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 NIM1KQ8IY84 436 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 CERKQ8TCT0 537 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL21A1Q96P44 957 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIT2Q99578 217 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGLLQ99685 303 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR14Q9BWN1 585 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 MROH8Q9H579 483 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 BRD9Q9H8M2 597 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 GHRLQ9UBU3 117 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOCS7O14512 581 aa6.64□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 CA12O43570 354 aa6.64□□□□□ -1.35
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRAP2O75791 330 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms