RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 FITM1A5D6W6 292 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 GMNCA6NCL1 334 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LRIT2A6NDA9 550 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 H0YIG0 161 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 STMND1H3BQB6 276 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF749O43361 778 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SEC22BO75396 215 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TNFSF15O95150 251 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TGFB1P01137 390 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PDYNP01213 254 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ALOX12P18054 663 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 EPORP19235 508 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SSR2P43308 183 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 MTTPP55157 894 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 GNGT1P63211 74 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 GABREP78334 506 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 OCRLQ01968 901 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 OCA2Q04671 838 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 KCNAB1Q14722 419 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SLC9A5Q14940 896 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RPS6KA2Q15349 733 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ZIC1Q15915 447 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ST3GAL2Q16842 350 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 NXNQ6DKJ4 435 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PLD3Q8IV08 490 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ESX1Q8N693 406 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 USP7Q93009 1102 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 COL26A1Q96A83 441 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PPM1MQ96MI6 270 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RILPQ96NA2 401 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SERINC2Q96SA4 455 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 NRTNQ99748 197 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 FAM60AQ9NP50 221 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf109Q9NX04 203 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PHF11Q9UIL8 331 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PSME2Q9UL46 239 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SATB2Q9UPW6 733 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TIMM22Q9Y584 194 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN4O14493 209 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 DSCR3O14972 297 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ITM2AO43736 263 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 DIAPH2O60879 1101 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00032P0C843 101 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 JAK1P23458 1154 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PPP2R1BP30154 601 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 NEK2P51955 445 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PLA2G16P53816 162 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 STX1BP61266 288 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 BIKQ13323 160 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 MAP7Q14244 749 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms