RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 FAM189A2Q15884 450 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 GLRA4Q5JXX5 417 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 CES4AQ5XG92 561 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 IYDQ6PHW0 289 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 KCTD9Q7L273 389 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FAM89BQ8N5H3 189 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 NAT8LQ8N9F0 302 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ZNF248Q8NDW4 579 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 OR6S1Q8NH40 331 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ZNF519Q8TB69 540 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ATP8B4Q8TF62 1192 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ARHGAP45Q92619 1136 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 NYXQ9GZU5 481 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 UBQLN3Q9H347 655 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PNPLA3Q9NST1 481 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 TMOD3Q9NYL9 352 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 IL36AQ9UHA7 158 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SATB2Q9UPW6 733 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FER1L5A0AVI2 2057 aa2.77□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 C5orf51A6NDU8 294 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ANHXE9PGG2 379 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PSMA7O14818 248 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 STX6O43752 255 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 KRT33AO76009 404 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 UROSP10746 265 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 NOVP48745 357 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 IRX4P78413 519 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 TAB1Q15750 504 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SLC10A5Q5PT55 438 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ASPGQ86U10 573 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PRSS35Q8N3Z0 413 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 AQP11Q8NBQ7 271 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 MAPK15Q8TD08 544 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 AFAP1L1Q8TED9 768 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 OSBPL8Q9BZF1 889 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 BARHL2Q9NY43 387 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 POLKQ9UBT6 870 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PLCL2Q9UPR0 1127 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.76□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 PFASO15067 1338 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 A0A087X0K7 114 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ZNF263O14978 683 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SIGLEC5O15389 551 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ATP9AO75110 1047 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 AKAP3O75969 853 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 HMOX1P09601 288 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 OAS2P29728 719 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 VEGFCP49767 419 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ERVK11-1P61568 191 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ABRQ12979 859 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FAM106AQ4KMX7 169 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SPANXN4Q5MJ08 99 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 C11orf88Q6PI97 169 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 LSMEM2Q8N112 164 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 TEX26Q8N6G2 289 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SMPDL3AQ92484 453 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 KRT35Q92764 455 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 SLCO2A1Q92959 643 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 AP2M1Q96CW1 435 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 C18orf12Q96KH6 178 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 ASCL2Q99929 193 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 CUEDC2Q9H467 287 aa2.75□□□□□ -1.97
SENP6-208ENST00000483859 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms