RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.761e-10■■□□□ 14.1
ACTB-211ENST00000480301 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TTLQ8NG68 377 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 OR11G2Q8NGC1 345 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 OR5T3Q8NGG3 340 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SEC16BQ96JE7 1060 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A23Q9BV35 468 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 XPR1Q9UBH6 696 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 FBXL4Q9UKA2 621 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 URADA6NGE7 173 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF860A6NHJ4 632 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 A6NL46 340 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SHBGP04278 402 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 HEXBP07686 556 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SBK3P0C264 359 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GSTM2P28161 218 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 XCR1P46094 333 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 RAB8AP61006 207 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 LAPTM5Q13571 262 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 DEFB134Q4QY38 66 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ADNP2Q6IQ32 1131 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ABHD13Q7L211 337 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TEX9Q8N6V9 391 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CLEC1AQ8NC01 280 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 FDCSPQ8NFU4 85 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MZB1Q8WU39 189 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SCYL1Q96KG9 808 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CCDC77Q9BR77 488 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 RHBGQ9H310 441 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 KALRNO60229 2985 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CFAP46Q8IYW2 2715 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ALOX12BO75342 701 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CLEC3AO75596 197 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 EPB42P16452 691 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SOX8P57073 446 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TUBB8Q3ZCM7 444 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 NIPAL1Q6NVV3 410 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ASB18Q6ZVZ8 466 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GALNT16Q8N428 558 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 C8orf44Q96CB5 159 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 NUDT9Q9BW91 350 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MKL2Q9ULH7 1088 aa19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 LRIT2A6NDA9 550 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ANKDD1BA6NHY2 528 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ACPPP15309 386 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 OLR1P78380 273 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ADPRMQ3LIE5 342 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PAGE2BQ5JRK9 111 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 FAAH2Q6GMR7 532 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TMEM205Q6UW68 189 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CCT6BQ92526 530 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MS4A6EQ96DS6 147 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PEX11GQ96HA9 241 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 VN1R1Q9GZP7 353 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TBK1Q9UHD2 729 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TMCO1Q9UM00 188 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQ72 361 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 OR2W5A6NFC9 320 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 E2F3O00716 465 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CHST10O43529 356 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 COX6A1P12074 109 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PGDP52209 483 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SKP1P63208 163 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
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ACTB-211ENST00000480301 GTF2H2Q13888 395 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 LAS2Q8IYD9 372 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GAL3ST3Q96A11 431 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PHF21BQ96EK2 531 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 VPS50Q96JG6 964 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 LANCL2Q9NS86 450 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GPR83Q9NYM4 423 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TMEM216Q9P0N5 145 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 V9GYY5 206 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF462Q96JM2 2506 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa19.77■□□□□ 0.76
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