RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT8Q92599 483 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 DYRK2Q92630 601 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF4BQ92750 862 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 HAS2Q92819 552 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GUCD1Q96NT3 240 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 LPAR4Q99677 370 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 WACQ9BTA9 647 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 WWTR1Q9GZV5 400 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 A8MVM7 634 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SNURFLB1AK76 121 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CHUKO15111 745 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX28O15482 410 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMD3O43242 534 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 EXTL3O43909 919 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT36O76013 467 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 STBD1O95210 358 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNA2P20248 432 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFSF10P50591 281 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1D5P58170 312 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVFC1-1P60608 527 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SGCGQ13326 291 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC6Q16204 474 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MACC1Q6ZN28 852 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 STHQ8IWL8 128 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNYQ8ND76 341 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 PIGVQ9NUD9 493 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ACTR3BQ9P1U1 418 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SPASTQ9UBP0 616 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SATB2Q9UPW6 733 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0G2JLW4 131 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP73A6NFT4 308 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 P2RY10O00398 339 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP6V1G1O75348 118 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CLPTM1O96005 669 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NGFP01138 241 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CXCL10P02778 98 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MT-ND2P03891 347 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT17P0C025 328 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SKILP12757 684 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ETS1P14921 441 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ANPEPP15144 967 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP3A5P20815 502 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ACP1P24666 158 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CAMLGP49069 296 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GPC3P51654 580 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 LBX1P52954 281 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 DCDC1P59894 354 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL16Q0P5N6 197 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH18Q13634 790 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ITGA9Q13797 1035 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GRB14Q14449 540 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF74Q16587 644 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ADCK1Q86TW2 530 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2T11Q8NH01 316 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4A16Q8NH70 328 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SUSD6Q92537 303 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GIMAP5Q96F15 307 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 C10orf90Q96M02 699 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNK16Q96T55 309 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NTMT1Q9BV86 223 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP28Q9H239 520 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms