RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TRIM64BA6NI03 449 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 HSPB2A8KAH6 182 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 DNAJB6O75190 326 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ITGA10O75578 1167 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CCNDBP1O95273 360 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 METTL18O95568 372 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 FHP07954 510 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CELA3AP09093 270 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 GABRA1P14867 456 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TMED2Q15363 201 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TERF2Q15554 542 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 HSPB2Q16082 182 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 KCT2Q8NC54 265 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 OR4L1Q8NH43 312 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF480Q8WV37 535 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PEX13Q92968 403 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 THAP11Q96EK4 314 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PEX11GQ96HA9 241 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 BIRC8Q96P09 236 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CR1P17927 2039 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 FAM166BA8MTA8 275 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 H7C0C1 242 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 KPNA5O15131 536 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 WIPF1O43516 503 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 HCN1O60741 890 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 SOX30O94993 753 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 SLC16A8O95907 504 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 STATHP02808 62 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 RBP3P10745 1247 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PTPN7P35236 360 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TIMP3P35625 211 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 HSD17B2P37059 387 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MAGEA5P43359 124 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ATP5OP48047 213 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF136P52737 540 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PNLIPRP1P54315 467 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PARP6Q2NL67 630 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC38Q502W7 563 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 IQCDQ96DY2 449 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PANX3Q96QZ0 392 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PKP4Q99569 1192 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMC1-202ENST00000466964 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 H7BY64 318 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 ACOT7O00154 380 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 SMAPO00193 183 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 CLDN4O14493 209 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 DVL2O14641 736 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMC1-202ENST00000466964 PJA2O43164 708 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms