RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ARSFP54793 590 aa8.95□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 SKP1P63208 163 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MC2RQ01718 297 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 HERC3Q15034 1050 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MUM1Q2TAK8 710 aa8.95□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.95□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6AP2O75787 350 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G16P53816 162 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 OGFOD2Q6N063 350 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CGB2Q6NT52 195 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP4-208ENST00000462602 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 METTL4Q8N3J2 472 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KCT2Q8NC54 265 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2T11Q8NH01 316 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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