RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, human

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNN3-204	ENST00000461018	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CTNNA2	P26232	953 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	ECHS1	P30084	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CRHR1	P34998	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	GJC1	P36383	396 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CD86	P42081	329 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	ZNF75D	P51815	510 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CHN2	P52757	468 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SMS	P52788	366 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CLRN1	P58418	232 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PDE1B	Q01064	536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PMP22	Q01453	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	AP1B1	Q10567	949 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	MPP3	Q13368	585 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	ADRM1	Q16186	407 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	DYSF	O75923	2080 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CNN3-204	ENST00000461018	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	LDB2	O43679	373 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	PRKD3	O94806	890 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	TOX	O94900	526 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	TJP3	O95049	919 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	ZWINT	O95229	277 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	CLDN7	O95471	211 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	MT-ND3	P03897	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	ALPP	P05187	535 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	F3	P13726	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	CTPS1	P17812	591 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	VCL	P18206	1134 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	PTPN3	P26045	913 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	GEM	P55040	296 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	DLX5	P56178	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	RWDD2B	P57060	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	DMPK	Q09013	629 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	MYBPH	Q13203	477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNN3-204	ENST00000461018	TUBB3	Q13509	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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