RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SCN2AQ99250 2005 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SH3D21A4FU49 640 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 RNF223E7ERA6 249 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 H7BY64 318 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 H7C0C1 242 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SUSD5O60279 629 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 IL2RAP01589 272 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CNR1P21554 472 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 AOAHP28039 575 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 RBL1P28749 1068 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FOXN2P32314 431 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ATP5OP48047 213 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 DNASE1L1P49184 302 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PTH2RP49190 550 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CLCN2P51788 898 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF136P52737 540 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 UBE2HP62256 183 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OLR1P78380 273 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 BTG2P78543 158 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SORDQ00796 357 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM14Q14142 442 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ICE2Q659A1 982 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF425Q6IV72 752 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 GK5Q6ZS86 529 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PDSS2Q86YH6 399 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KCT2Q8NC54 265 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 STYXQ8WUJ0 223 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ASB15Q8WXK1 588 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SMPDL3AQ92484 453 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SMPDL3BQ92485 455 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FOPNLQ96NB1 174 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 DACH2Q96NX9 599 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CARD6Q9BX69 1037 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LANCL2Q9NS86 450 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR2J2O76002 312 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR6B1O95007 311 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CCNDBP1O95273 360 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FHP07954 510 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 H2AFZP0C0S5 128 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CCNFP41002 786 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TRPC1P48995 793 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 XKR6Q5GH73 641 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KCTD11Q693B1 232 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 H2AFVQ71UI9 128 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ABHD13Q7L211 337 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PCGF5Q86SE9 256 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LUZP2Q86TE4 346 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 VSIG1Q86XK7 387 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LIX1Q8N485 282 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ISL2Q96A47 359 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC45Q96CN5 670 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR1F2PQ96R84 312 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC77Q9BR77 488 aa6.65□□□□□ -1.34
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