RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430617.6

ATG4B-212, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-212ENST00000430617 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 CCDC63Q8NA47 563 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 OR2L2Q8NH16 312 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ARSGQ96EG1 525 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 OXSMQ9NWU1 459 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TINAGQ9UJW2 476 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 WDR91A4D1P6 747 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 KLHL33A6NCF5 533 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 C9J4A7 227 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 UBXN8O00124 270 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 KMOO15229 486 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 KLHL18O94889 574 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 MATN4O95460 622 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ARRB2P32121 409 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 FOLR3P41439 243 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 SMSP52788 366 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 NFE2L1Q14494 772 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 CEBPEQ15744 281 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 CHI3L2Q15782 390 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 PHKG1Q16816 387 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 LIPMQ5VYY2 423 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 PDPRQ8NCN5 879 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 DLG3Q92796 817 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 AGAP4Q96P64 663 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TMEM237Q96Q45 408 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 RNF112Q9ULX5 631 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 OARD1Q9Y530 152 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 SCN2AQ99250 2005 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-212ENST00000430617 ZANQ9Y493 2812 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 OR5K3A6NET4 321 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 SYCE1LA8MT33 242 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 GFYI3L273 518 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 SLC16A5O15375 505 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 SLC19A2O60779 497 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 IGHEP01854 428 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 SERPINE1P05121 402 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 C8GP07360 202 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 PDHA2P29803 388 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 PRKAA2P54646 552 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 DNAJB13P59910 316 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 ADAM8P78325 824 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 OCRLQ01968 901 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 BST1Q10588 318 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 RPA4Q13156 261 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 SLC9A5Q14940 896 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 TGFBIQ15582 683 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 CYP2A13Q16696 494 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 CGB2Q6NT52 195 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 AMZ2Q86W34 360 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 ASB11Q8WXH4 323 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 EXT2Q93063 718 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 CCDC126Q96EE4 140 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-212ENST00000430617 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms