RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 CRATP43155 626 aa13.13□□□□□ -0.31
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THBS3-202ENST00000428962 SHHQ15465 462 aa13.13□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
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THBS3-202ENST00000428962 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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THBS3-202ENST00000428962 NODALQ96S42 347 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 ZNF347Q96SE7 839 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 AIF1LQ9BQI0 150 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 SPNS1Q9H2V7 528 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 RUBCNLQ9H714 662 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.12□□□□□ -0.31
THBS3-202ENST00000428962 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.12□□□□□ -0.31
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