RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412272.6

HERC4-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-205ENST00000412272 ICAM3P32942 547 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 STAT5AP42229 794 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TECP42680 631 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MAGEA6P43360 314 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SLC1A6P48664 564 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 POU4F2Q12837 409 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SKP2Q13309 424 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ANGPT1Q15389 498 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 GPR19Q15760 415 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MPPED2Q15777 294 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 LGSNQ5TDP6 509 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 WSCD1Q658N2 575 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SHFQ7M4L6 423 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 LUZP2Q86TE4 346 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 BVESQ8NE79 360 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MCFD2Q8NI22 146 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ING5Q8WYH8 240 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 LXNQ9BS40 222 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CCDC32Q9BV29 185 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MMP28Q9H239 520 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MUC13Q9H3R2 512 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MARK1Q9P0L2 795 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MKLN1Q9UL63 735 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 DNPEPQ9ULA0 475 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 STUB1Q9UNE7 303 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 XKRY2A2RUG3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 FAM149AA5PLN7 773 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 I6L893 689 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 HSPA12AO43301 675 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 EDIL3O43854 480 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CYP7A1P22680 504 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TUBG1P23258 451 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 DDTP30046 118 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 RABIFP47224 123 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SLC11A1P49279 550 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 NAPAP54920 295 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SKP1P63208 163 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TP53BP2Q13625 1128 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 OR8G1Q15617 311 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 FBXO17Q96EF6 278 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MOKQ9UQ07 419 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 QSOX1O00391 747 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 PROSCO94903 275 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 HPRP00739 348 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 UQCRC2P22695 453 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CRHBPP24387 322 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ADORA2AP29274 412 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TGFBR2P37173 567 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 LHX1P48742 406 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ALDH3A2P51648 485 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 SLC7A9P82251 487 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 RAB33AQ14088 237 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TAZQ16635 292 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 GJB7Q6PEY0 223 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ZFP82Q8N141 532 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ACTL9Q8TC94 416 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 TMBIM1Q969X1 311 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 ZFP42Q96MM3 310 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 APOL4Q9BPW4 351 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 NUAK2Q9H093 628 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 GKN1Q9NS71 199 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC4-205ENST00000412272 KCND3Q9UK17 655 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms