RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409237.5

GALNT13-202, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT13, Length 2,591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT13-202ENST00000409237 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CDK19Q9BWU1 502 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TINAGQ9UJW2 476 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 GGA2Q9UJY4 613 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 BCORL1Q5H9F3 1711 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 XDHP47989 1333 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 KDM5CP41229 1560 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MROH6A6NGR9 719 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ACOD1A6NK06 481 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ABCD4O14678 606 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ARHGEF9O43307 516 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 LDB3O75112 727 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ZNF254O75437 659 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RALBP11234 206 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 SPINK2P20155 84 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CPN2P22792 545 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 SSTR4P31391 388 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TNFSF10P50591 281 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CDH18Q13634 790 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 LRRC66Q68CR7 880 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MARK4Q96L34 752 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 FZD10Q9ULW2 581 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 IFT52Q9Y366 437 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ZNF536O15090 1300 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ADAMTS12P58397 1594 aa4.6□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 LINC00473A8K010 186 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 DIRC3C9JPN6 131 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MS4A18H0YCH9 400 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 J3KR12 359 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 FAM20BO75063 409 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MAOAP21397 527 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RAP1GAPP47736 663 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 HERV-K104P63124 156 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ZXDBP98169 803 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 PDK3Q15120 406 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 SNCBQ16143 134 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 PCID2Q5JVF3 399 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CEP85Q6P2H3 762 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 THAP8Q8NA92 274 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 GRIN2AQ12879 1464 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 A8MUI8 341 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 E9PI62 339 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 H3BQF6 201 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RNF8O76064 485 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 RHOBTB1O94844 696 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 NXPH3O95157 252 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 IDO1P14902 403 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 EPCAMP16422 314 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TNNI3P19429 210 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ABATP80404 500 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 P2RY14Q15391 338 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MPPE1Q53F39 396 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 KLC3Q6P597 504 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 EMC1Q8N766 993 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GALNT13-202ENST00000409237 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms