RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 FADDQ13158 208 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 IFI44LQ53G44 452 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 M0R3G1 203 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFRSF11BO00300 401 aa22.17■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 NR4A1P22736 598 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PIK3CBP42338 1070 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 HBA1P69905 142 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ELP6Q0PNE2 266 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC80Q76M96 950 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 OXR1Q8N573 874 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 S100ZQ8WXG8 99 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MYOCQ99972 504 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 HMG20AQ9NP66 347 aa22.17■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 AASSQ9UDR5 926 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ERGIC3Q9Y282 383 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PTPRSQ13332 1948 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 J3QRK9 145 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SOD1P00441 154 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TFPTP0C1Z6 253 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 EPHA2P29317 976 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 AQP1P29972 269 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPINB10P48595 397 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 DGUOKQ16854 277 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM124AQ86V42 546 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 METTL4Q8N3J2 472 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 OR2AG1Q9H205 316 aa22.16■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 C6orf47O95873 294 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB46Q86UZ6 589 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 SAMD11Q96NU1 681 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ANXA8P13928 327 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGB7P26010 798 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 GRK3P35626 688 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ENTHD1Q8IYW4 607 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF366Q8N895 744 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 THSD1Q9NS62 852 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.15■■□□□ 1.14
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