RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397617.7

PTPRD-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-206ENST00000397617 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 ITFG2Q969R8 447 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 CCL26Q9Y258 94 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 PLK4O00444 970 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 AKAP10O43572 662 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 PLOD3O60568 738 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 RABIFP47224 123 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 CHPFQ8IZ52 775 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 SVOPQ8N4V2 548 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 ZNF675Q8TD23 568 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 SCAMP4Q969E2 229 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 OR2A25A4D2G3 310 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 F3P13726 295 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 HTTP42858 3142 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-206ENST00000397617 SUV39H1O43463 412 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 RASGRP1O95267 797 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 UQCRC2P22695 453 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 RABGGTBP53611 331 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 NFE2L1Q14494 772 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 FAHD1Q6P587 224 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 DOHHQ9BU89 302 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-206ENST00000397617 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.63□□□□□ -1.51
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