RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 SPC24Q8NBT2 197 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MUL1Q969V5 352 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 C10orf90Q96M02 699 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MIPEPQ99797 713 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 KIFC1Q9BW19 673 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SYBUQ9NX95 663 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ESPL1Q14674 2120 aa6.64□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 PCM1Q15154 2024 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 NIPSNAP2O75323 286 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 NDUFS3O75489 264 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 VAPBO95292 243 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MATN4O95460 622 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 CLDN1O95832 211 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SCG5P05408 212 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TPSB2P20231 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MGAT1P26572 445 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ATP5DP30049 168 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA7P48741 367 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 NPY2RP49146 381 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 Q0VFX4 171 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 POU4F3Q15319 338 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 RPS6KA1Q15418 735 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TPSAB1Q15661 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TTC23LQ6PF05 361 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 CES3Q6UWW8 571 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 C4orf22Q6V702 233 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 KRT84Q9NSB2 600 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 BFARQ9NZS9 450 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 GALPQ9UBC7 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 POLEQ07864 2286 aa6.63□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 A0A0J9YVX5 310 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PQ72 361 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 HYKKA2RU49 373 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MYO1CO00159 1063 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 AP3B1O00203 1094 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 OIP5O43482 229 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ESR1P03372 595 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MAGEA6P43360 314 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 KCNJ1P48048 391 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 GLRBP48167 497 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 CDK16Q00536 496 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 KLC1Q07866 573 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 RBBP7Q16576 425 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.62□□□□□ -1.35
CTXN3-201ENST00000379445 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms