RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf44Q8N8P7 122 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ENKURQ8TC29 256 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FKBP10Q96AY3 582 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PARD6BQ9BYG5 372 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 EXO5Q9H790 373 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MINDY3Q9H8M7 445 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 EPB41L5Q9HCM4 733 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GRHL1Q9NZI5 618 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 COPG2Q9UBF2 871 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TTC21AQ8NDW8 1320 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQ72 361 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PAX4O43316 350 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TPST1O60507 370 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RPN2P04844 631 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2G4BP0C869 781 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RAP2AP10114 183 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MATN1P21941 496 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.031e-10■■■□□ 14.9
CCSAP-202ENST00000366686 IFNA8P32881 189 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SCRN3Q0VDG4 424 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DYRK1AQ13627 763 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RAPSNQ13702 412 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF528Q3MIS6 628 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 WDR72Q3MJ13 1102 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ATAD3BQ5T9A4 648 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FAM173BQ6P4H8 233 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 C4orf22Q6V702 233 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NOXA1Q86UR1 476 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 COMTD1Q86VU5 262 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 METTL13Q8N6R0 699 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB8AQ96BR9 441 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ITCHQ96J02 903 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SNX18Q96RF0 628 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CALN1Q9BXU9 219 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RAB20Q9NX57 234 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GMEB2Q9UKD1 530 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ANGPT4Q9Y264 503 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CEPT1Q9Y6K0 416 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CACNA1EQ15878 2313 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3EA0A087X179 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0B4J293 547 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRG6 482 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3BA6NDS4 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SMCO2A6NFE2 343 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A8MXQ7 604 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3LB9A6J9 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SPAG7O75391 227 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KDM4BO94953 1096 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BAG3O95817 575 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCGP05129 697 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3HP0C7X1 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DLATP10515 647 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RALAP11233 206 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HOXC9P31274 260 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 AKT2P31751 481 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GMPRP36959 345 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SSTP61278 116 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PSMC5P62195 406 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LIPEQ05469 1076 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BST2Q10589 180 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DOC2BQ14184 412 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO48Q5FWF7 155 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 AGBL2Q5U5Z8 902 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 METTL21CQ5VZV1 264 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf94Q6P1W5 598 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FOXR2Q6PJQ5 311 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms