RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 C3orf33Q6P1S2 294 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LINC00471Q8N535 108 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 HSPB11Q9Y547 144 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NOTOA8MTQ0 251 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ACADVLP49748 655 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 S100A12P80511 92 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SMARCD2Q92925 531 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ACDQ96AP0 544 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 MANBAO00462 879 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GDF5P43026 501 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 WDR4P57081 412 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GLS2Q9UI32 602 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PROM1O43490 865 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RAB15P59190 212 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMEM74Q96NL1 305 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 HCN2Q9UL51 889 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RNF6Q9Y252 685 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 AHSA1O95433 338 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 IFNA2P01563 188 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 MATN1P21941 496 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 MLLT10P55197 1068 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TUBA1BP68363 451 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LAPTM4AQ15012 233 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LBX2Q6XYB7 198 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TUBA1AQ71U36 451 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.57■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GLTPD2A6NH11 291 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PDGFRLQ15198 375 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CREG1O75629 220 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FPR1P21462 350 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TLE2Q04725 743 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMIEQ8NEW7 156 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PRELID1Q9Y255 219 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TRIM64BA6NI03 449 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 MAGEA8P43361 318 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FUT2Q10981 343 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GRIK2Q13002 908 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TUBA3CQ13748 450 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SMPDL3AQ92484 453 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FANCFQ9NPI8 374 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 DKKL1Q9UK85 242 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PPL8 197 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ13O60928 360 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CLDN7O95471 211 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 INHAP05111 366 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GNRHRP30968 328 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GDI1P31150 447 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 COQ8AQ8NI60 647 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 C17orf50Q8WW18 174 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 BIRC7Q96CA5 298 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZNF599Q96NL3 588 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RNF38Q9H0F5 515 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR51B5Q9H339 312 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 DLX3O60479 287 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 C6orf47O95873 294 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CSF2P04141 144 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 G6PDP11413 515 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A6P31641 620 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FBXL22Q6P050 247 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZVU0 165 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FBXL20Q96IG2 436 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.56■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PRKCZQ05513 592 aa15.55■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZNF404Q494X3 552 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms