RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 ALOX5P09917 674 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 BMP2P12643 396 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CDH1P12830 882 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC2A4P14672 509 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 IDUAP35475 653 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MAPK9P45984 424 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TMBIM6P55061 237 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MLLT10P55197 1068 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MERTKQ12866 999 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PERM1Q5SV97 790 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF347Q96SE7 839 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TUBA1CQ9BQE3 449 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 METTL12A8MUP2 240 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MATN1P21941 496 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 HPCAL1P37235 193 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 YPEL5P62699 121 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF846Q147U1 533 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CBR4Q8N4T8 237 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SGPP1Q9BX95 441 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.14□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CLDN25C9JDP6 229 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 NR5A2O00482 541 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SEC22BO75396 215 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 JRKO75564 520 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MYO1DO94832 1006 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TNFP01375 233 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 STATHP02808 62 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PRR35P0CG20 571 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 JUPP14923 745 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GPX3P22352 226 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OPRL1P41146 370 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FNTBP49356 437 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 UFM1P61960 85 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SQLEQ14534 574 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RPS6KA2Q15349 733 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC36A3Q495N2 470 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 BTLAQ7Z6A9 289 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PLD3Q8IV08 490 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 L3MBTL4Q8NA19 623 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 USP7Q93009 1102 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ICKQ9UPZ9 632 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 IFT52Q9Y366 437 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FEZF1A0PJY2 475 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF839A8K0R7 811 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GMNNO75496 209 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KCNH1O95259 989 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ETHE1O95571 254 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KRT6AP02538 564 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KRT6BP04259 564 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RPN2P04844 631 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 G6PDP11413 515 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KRT6CP48668 564 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 STX1BP61266 288 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SELENBP1Q13228 472 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PTGR1Q14914 329 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FRG2Q64ET8 278 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CYGBQ8WWM9 190 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 APIPQ96GX9 242 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FBXL20Q96IG2 436 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms