RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC6A16Q9GZN6 736 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNPO2LQ9H987 977 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 AIG1Q9NVV5 245 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP10A1A4S6 786 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERI3O43414 337 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPS2P11908 318 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACPPP15309 386 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP4BP51164 291 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G16P53816 162 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIO3P55073 304 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCTE1Q5JU00 501 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 WASHC2DQ5SRD0 308 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM9CQ8IZT9 166 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIER2Q8N344 545 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2L5Q8NG80 312 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A6EQ96DS6 147 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNC2Q96PR1 638 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYLK2Q9H1R3 596 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL31Q9H511 634 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 FANCEQ9HB96 536 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASIC5Q9NY37 505 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPP1O14494 284 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFPL3O75679 317 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCSK2P16519 638 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 HYAL2Q12891 473 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNAB1Q14722 419 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADPRMQ3LIE5 342 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD13Q7L211 337 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLNKQ7Z7G1 428 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIP4P1Q86T03 277 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIX1Q8N485 282 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCT2Q8NC54 265 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAL3ST3Q96A11 431 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHOX2BQ99453 314 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMCX1Q9P291 453 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPN7Q9Y6W3 813 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RX6O15547 441 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH7O60245 1069 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK1P06870 262 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 G6PDP11413 515 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSR2P43308 183 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARFIP1P53367 373 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 HKDC1Q2TB90 917 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C11Q6IEV9 310 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP20A1Q6UW02 462 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 FITM2Q8N6M3 262 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf62Q9BQA9 187 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 EBPLQ9BY08 206 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRT5Q9NXA8 310 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A088AWK7 358 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCT8L1PA6NM43 557 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCRTR1O43613 425 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCKDHAP12694 445 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIMK1P53667 647 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT13Q86X67 352 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCBTB1Q8NDN9 531 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCRL1Q96LA6 429 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM74Q96NL1 305 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBCDQ9BTW9 1192 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR45Q9Y5Y3 372 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM150CB9EJG8 249 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A2O15244 555 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRA4P48169 554 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 NME5P56597 212 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB8AP61006 207 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFA9Q16795 377 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT18Q6P9A2 607 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD17CQ6PCB6 329 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLITRK4Q8IW52 837 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRINP2Q9C0B6 783 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ROGDIQ9GZN7 287 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF385DQ9H6B1 395 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 STARD5Q9NSY2 213 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCM8Q9UJA3 840 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERTAD3Q9UJW9 196 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM29Q9UKF5 820 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms