RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 PCTPQ9UKL6 214 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TYRP1P17643 537 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 GRIK2Q13002 908 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TRNP1Q6NT89 227 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ARL9Q6T311 187 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MED28Q9H204 178 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 GIN1Q9NXP7 522 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 SLC16A5O15375 505 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CD2P06729 351 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF823P16415 610 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TGFBR2P37173 567 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TLR1Q15399 786 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM25Q86YD3 366 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 WDR45Q9Y484 360 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 NUP98P52948 1817 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 T-ENOLP0DO92 83 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 JUPP14923 745 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MATN1P21941 496 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CCKBRP32239 447 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 KCNC4Q03721 635 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 KDELC1Q6UW63 502 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 HSDL2Q6YN16 418 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 A0A1W2PP55 124 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 PTNP21246 168 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MAGEA6P43360 314 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 RAB33AQ14088 237 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 XKR4Q5GH76 650 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CDH11P55287 796 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TBPL1P62380 186 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ENPP2Q13822 863 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 PTERQ96BW5 349 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 DGAT2Q96PD7 388 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TRIB3Q96RU7 358 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 LATS1O95835 1130 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 GMFBP60983 142 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 FBXO43Q4G163 708 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00471Q8N535 108 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CHST14Q8NCH0 376 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 KXD1Q9BQD3 176 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TGM5O43548 720 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 RCBTB2O95199 551 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 BCAP31P51572 246 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 DHCR24Q15392 516 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 Q9N2J8 555 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 VIPR2P41587 438 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 SPINT3P49223 89 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 SCRN2Q96FV2 425 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MGME1Q9BQP7 344 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 IL17CQ9P0M4 197 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 PHF24Q9UPV7 400 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MYH1P12882 1939 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CPED1A4D0V7 1026 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 KANK2Q63ZY3 851 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 DSN1Q9H410 356 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-201ENST00000308580 MTG2Q9H4K7 406 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms