RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 C19orf60Q96EN9 201 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 FAR2Q96K12 515 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 C3orf30Q96M34 536 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SERPINI1Q99574 410 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 NUF2Q9BZD4 464 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 BRF2Q9HAW0 419 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PPT2Q9UMR5 302 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CACNA1BQ00975 2339 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SERTM1A2A2V5 107 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 TXNDC9O14530 226 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 HDAC3O15379 428 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SCRG1O75711 98 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 TNFSF15O95150 251 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ZNF28P17035 718 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 IL1RNP18510 177 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PLA2G16P53816 162 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 RAB8AP61006 207 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ZNF33BQ06732 778 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 IMPG1Q17R60 797 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 OR2L5Q8NG80 312 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 TAAR9Q96RI9 348 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 DDA1Q9BW61 102 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CUTCQ9NTM9 273 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 C9orf172C9J069 976 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLC28A1O00337 649 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PLPP1O14494 284 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SDHDO14521 159 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ZNF195O14628 629 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ATP6AP2O75787 350 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 KIAA0754O94854 1291 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 NTRK1P04629 796 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 RAP1GDS1P52306 607 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SEC24CP53992 1094 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CUL3Q13618 768 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 NR6A1Q15406 480 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 MUM1Q2TAK8 710 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 DEFB134Q4QY38 66 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CGB2Q6NT52 195 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CHSY3Q70JA7 882 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PDSS2Q86YH6 399 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 NDC1Q9BTX1 674 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 NPHS2Q9NP85 383 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 LHX9Q9NQ69 397 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 WASF3Q9UPY6 502 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 DSCR3O14972 297 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 RGS14O43566 566 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 FOXS1O43638 330 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 KLHL18O94889 574 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SEMA3DO95025 777 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL25-201ENST00000253451 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms