RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 PPT2Q9UMR5 302 aa24.86■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.86■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 FCHO1O14526 889 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ERI3O43414 337 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 GFRA3O60609 400 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ANKRD34CP0C6C1 535 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 SLC35G6P0C7Q6 338 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 GSTM2P28161 218 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 RAP1GDS1P52306 607 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 LIMK1P53667 647 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 RGS1Q08116 209 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CUL3Q13618 768 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 IL23RQ5VWK5 629 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CHSY3Q70JA7 882 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 SLCO6A1Q86UG4 719 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 KMT5CQ86Y97 462 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 DTWD1Q8N5C7 304 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 AMER3Q8N944 861 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ARMCX1Q9P291 453 aa24.85■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 MAP3K7O43318 606 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 PWP1Q13610 501 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ADPRMQ3LIE5 342 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 OGFOD2Q6N063 350 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 DHRS13Q6UX07 377 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CAMKVQ8NCB2 501 aa24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 EEDO75530 441 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CD1EP15812 388 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 EMX2Q04743 252 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 HOMEZQ8IX15 550 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 METTL4Q8N3J2 472 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 OR1L3Q8NH93 324 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 SAR1AQ9NR31 198 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 NMRK1Q9NWW6 199 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 NPIPB8E9PQR5 432 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 MED26O95402 600 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 KLK1P06870 262 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 TACR1P25103 407 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 BSGP35613 385 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 PRSS41Q7RTY9 318 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 LIX1Q8N485 282 aa24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TOMM40-201ENST00000252487 G6PDP11413 515 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ILKQ13418 452 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SPIN4Q56A73 249 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMTC4Q5T4D3 741 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 NOXRED1Q6NXP6 359 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF793Q6ZN11 406 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SPATA19Q7Z5L4 167 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 OR2L5Q8NG80 312 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 NUDT8Q8WV74 236 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 RGMAQ96B86 450 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF385DQ9H6B1 395 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 FGF21Q9NSA1 209 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 AIG1Q9NVV5 245 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.82■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 C9JVG2 144 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 PCDH7O60245 1069 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 KLHL18O94889 574 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SEMA3DO95025 777 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 BCKDHAP12694 445 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 PTGR1Q14914 329 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 PRTGQ2VWP7 1150 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 GLRX5Q86SX6 157 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 OR8K5Q8NH50 307 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CDC26Q8NHZ8 85 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CFAP54Q96N23 3096 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SDC1P18827 310 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms