RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 DMRTB1Q96MA1 342 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 GABRB1P18505 474 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 SLC15A1P46059 708 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 HKDC1Q2TB90 917 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 CPTPQ5TA50 214 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF852Q6ZMS4 543 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 CEP19Q96LK0 163 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf43Q9BQ61 176 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 KLHL42Q9P2K6 505 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 TBC1D24Q9ULP9 559 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 BOLA1Q9Y3E2 137 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 DPM1O60762 260 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 ETHE1O95571 254 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 IGSF6O95976 241 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 CYP2A7P20853 494 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 PIK3CBP42338 1070 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 COX20Q5RI15 118 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC190Q86UF4 302 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 MKLN1Q9UL63 735 aa26.01■■□□□ 1.76
FAM149A-201ENST00000227065 C1orf226A1L170 272 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ANKRD34BA5PLL1 514 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 PRAMEF25A6NGN4 478 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 E7EQ34 232 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 GFYI3L273 518 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 RGS5O15539 181 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 CRATP43155 626 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 MLIPQ5VWP3 458 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 WDR20Q8TBZ3 569 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 RGS13O14921 159 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 GREM1O60565 184 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SOX6P35712 828 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 HTR3AP46098 478 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 STK19P49842 368 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SELENOWP63302 87 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 FBXO43Q4G163 708 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ZMAT1Q5H9K5 638 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SCRN2Q96FV2 425 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 MGLLQ99685 303 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SH3BP4Q9P0V3 963 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SERTM1A2A2V5 107 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 RACK1P63244 317 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 DOC2AQ14183 400 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 RNF180Q86T96 592 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 RAD9AQ99638 391 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 H3BM21 787 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ETFAP13804 333 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 PCSK2P16519 638 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 TXNDC8Q6A555 127 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 GPR156Q8NFN8 814 aa26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ADAMDEC1O15204 470 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 MAPK8P45983 427 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 RAE1P78406 368 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 IRF3Q14653 427 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 LIPJQ5W064 366 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 C11orf65Q8NCR3 313 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 OR2AP1Q8NGE2 309 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 LILRB4Q8NHJ6 448 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 VOPP1Q96AW1 172 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SLC30A2Q9BRI3 323 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 YIPF1Q9Y548 306 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ALPK3Q96L96 1907 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 GUCY1B2O75343 617 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 SLC10A3P09131 477 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 CD70P32970 193 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 TNFSF8P32971 234 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 LMAN2Q12907 356 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 GANABQ14697 944 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 NPAS3Q8IXF0 933 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 LYSMD1Q96S90 227 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 TCF25Q9BQ70 676 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 POFUT2Q9Y2G5 429 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM149A-201ENST00000227065 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms