RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GfapP03995 430 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstm1P10649 218 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crisp1Q03401 244 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emx2Q04744 253 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec24dQ6NXL1 1032 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r131Q7M708 310 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst8Q8BQ86 417 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UstQ8BUB6 407 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BWQ6 963 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plac9Q8K262 108 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr691Q8VGW5 322 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Depdc7Q91WS7 511 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad21l1A2AU37 552 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc43a3A2AVZ9 502 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btnl6A2CG22 539 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r91E9Q2U5 856 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc2a2P14246 523 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timp2P25785 220 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igfbp2P47877 305 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm9sf2P58021 662 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GuloP58710 440 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anxa4P97429 319 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LvrnQ2KHK3 559 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RogdiQ3TDK6 287 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5460Q3UQ97 254 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tusc1Q673H1 205 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zswim9Q6DI92 447 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txndc15Q6P6J9 344 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1197Q7TR13 314 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1196Q7TR14 314 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prap1Q80XD8 149 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan12Q8BKT6 305 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3cbQ8BTI9 1064 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf628Q8CJ78 1038 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl22Q8R1C6 393 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr357Q8VFP4 308 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam3cQ91VU0 227 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptov1Q91VU8 416 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa2013Q91X21 634 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan1Q99J59 240 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abtb1Q99LJ2 478 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Get4Q9D1H7 327 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GrifinQ9D1U0 144 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttyh1Q9D3A9 450 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmx1aQ9JKU8 382 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hacl1Q9QXE0 581 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmeff2Q9QYM9 374 aa12.21□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb34A2ATY4 518 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1215A3KGY3 312 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex16F6WNY1 1150 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3yl1O08641 340 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gcm2O09102 504 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtslP06797 334 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb8Q0VBD0 767 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc11Q14AK4 347 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Parp8Q3UD82 852 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrxosQ3UL53 246 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk15Q3V3A1 433 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkn2cQ60772 168 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angptl1Q640P2 490 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lix1Q6P566 282 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a10Q6P5F6 833 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcor1Q8CFE3 480 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd5Q8VC57 234 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb18Q8VHA6 467 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Papd4Q91YI6 484 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpy30Q99LT0 99 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trappc5Q9CQA1 188 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EbplQ9D0P0 206 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TesclQ9DAJ7 231 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgm1Q9JLF6 815 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plxna2P70207 1894 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxa4P06798 285 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7030Q0WXH6 285 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcgf5Q3UK78 256 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam46cQ5SSF7 391 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sim1Q61045 765 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Paqr3Q6TCG8 311 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcn3Q8BH97 328 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap19Q8BRH3 494 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LdahQ8BVA5 326 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam149aQ8CFV2 787 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BtdQ8CIF4 520 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam129bQ8R1F1 749 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ackr4Q924I3 350 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubox5Q925F4 539 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upk3bl1Q9D701 249 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glod5Q9D8I3 148 aa12.2□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PgdQ9DCD0 483 aa12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.6 ms