RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CopeO89079 308 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Becn2P0DM65 447 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh4P39038 913 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KapP61110 121 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Frat1P70339 274 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akr1clQ3UXL1 322 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akap14Q3V0I7 536 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo1gQ5SUA5 1024 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc25Q78PG9 208 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1133Q7TR44 313 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp398Q8BV16 643 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hat1Q8BY71 416 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps26bQ8C0E2 336 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a45Q8CFJ7 288 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt13Q8JZU0 352 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata2Q8K004 515 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Otud6bQ8K2H2 294 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Osgin1Q8VC10 478 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Capn8Q91VA3 703 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Man2c1Q91W89 1039 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TympQ99N42 471 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SelenosQ9BCZ4 190 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prelid3bQ9CYY7 195 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp26Q9D700 211 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acss2Q9QXG4 701 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxt1Q9QZV9 140 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Net1Q9Z206 595 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Speer3W4VSP1 261 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap77A0A087WRI3 283 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13040A2A8C4 496 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 L3mbtl4B1B1A0 621 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r49D3Z6L3 852 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spin2fJ3QPU0 254 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr611K7N609 323 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r32K7N686 852 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr612L7N462 323 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r42O35192 852 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UgdhO70475 493 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rfc1P35601 1131 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BtkP35991 659 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkx3-2P97503 333 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem248Q3TBN1 314 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dtx3lQ3UIR3 748 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc10a7Q5PT53 340 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11992Q5SS90 291 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ces2bQ6PDB7 556 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubtd2Q6PGH0 234 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr75Q6X632 540 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr798Q7TRH8 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RbsnQ80Y56 783 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfn1Q811U4 741 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elmo2Q8BHL5 732 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AgpsQ8C0I1 645 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxl22Q8C7B6 236 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sidt2Q8CIF6 832 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DolkQ8R2Y3 534 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc16Q8R349 620 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RergQ8R367 199 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smyd2Q8R5A0 433 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1008Q8VGC7 313 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1378Q8VGH0 315 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr690Q8VH18 315 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss42Q8VIF2 335 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif3hQ91WK2 352 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc130Q9D516 385 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mllt1Q9ERL0 547 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sp5Q9JHX2 398 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dmap1Q9JI44 468 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnmb4Q9JIN6 210 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccr10Q9JL21 362 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdcd7Q9WTY1 482 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Greb1Q3UHK3 1954 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmynd12A2BGJ5 363 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cped1B2RX70 1026 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FanceB8JJD6 213 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wscd2D4PHA7 571 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acbd4E9Q289 327 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap40E9Q6X9 672 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp60P16374 707 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eno2P17183 434 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp36P22893 319 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sstr1P30873 391 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrm4P32211 479 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Id2P41136 134 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2a12P56593 492 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kir3dl1P83555 432 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plk5Q4FZD7 595 aa10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 XiapQ60989 496 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.6 ms