RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000016569.10

Pds5b-201, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pds5b, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr1036Q7TR85 310 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Commd7Q8BG94 200 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Il17rdQ8JZL1 738 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Apbb3Q8R1C9 486 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Prokr1Q9JKL1 393 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 TescQ9JKL5 214 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Uchl1Q9R0P9 223 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Spaca6E9Q8Q8 339 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 TtlP38585 377 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 SirpaP97797 513 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc5a10Q5SWY8 596 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cbx5Q61686 191 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Get4Q9D1H7 327 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Phf11bB4XVQ1 276 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 SelenonD3Z2R5 557 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Chrna1P04756 457 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ap2s1P62743 142 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Q3KQP7 184 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccser2Q3UHI0 833 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cpa6Q5U901 438 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Riok2Q9CQS5 547 aa13□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Znf518bB2RRE4 1077 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Chrm1P12657 460 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trappc13Q3TIR1 417 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Zfp791Q497V9 528 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Klra4Q60651 263 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 ClmpQ8R373 373 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gnpda2Q9CRC9 276 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Fbxl12Q9EPX5 326 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Obox5G3X9P6 291 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Zfp715G3X9T1 886 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Man2b1O09159 1013 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Stc1O55183 247 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Brd7O88665 651 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 PgrQ00175 926 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cpa4Q6P8K8 420 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr164Q8VF87 315 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr952Q8VFD7 314 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trmt5Q9D0C4 501 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Med27Q9DB40 311 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rnf11Q9QYK7 154 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mrc1Q61830 1456 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 4930402K13RikB1AW18 415 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm3336J3QMQ6 198 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 TsxP70675 144 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 EdnraQ61614 427 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Paqr3Q6TCG8 311 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pgm2Q7TSV4 620 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gabbr2Q80T41 940 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr599Q8VG01 315 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cst14Q8VII3 130 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nudt7Q99P30 236 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 NagaQ9QWR8 415 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Znf354bQ9QXT9 601 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Hoxb6P09023 224 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ddx4Q61496 702 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tgfbr2Q62312 592 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trmt6Q8CE96 497 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr686Q8VGX3 317 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 MvdQ99JF5 401 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 9030624G23RikQ9D308 155 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Bin3Q9JI08 253 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ca5bQ9QZA0 317 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Syt5Q9R0N5 386 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Camta1A2A891 1682 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr519K7N645 319 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Esr1P19785 599 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cyp2a12P56593 492 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm5346Q7M766 736 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dpep2Q8C255 478 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gsg1Q8R1W2 324 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm26657Q9CVR1 127 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Lcn9Q9D267 178 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cers5Q9D6K9 414 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Prl8a8Q9DAS4 241 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 IvdQ9JHI5 424 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tap2P36371 702 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Grik2P39087 908 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Flt3Q00342 1000 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Lmf1Q3U3R4 574 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Lrrn1Q61809 716 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Wnt8aQ64527 354 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 MroQ7TNB4 248 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Lrrc56Q8K375 552 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Olfr692Q8VF03 329 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 B4galt3Q91YY2 395 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 ApmapQ9D7N9 415 aa12.99□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Vmn2r94E9PZK8 818 aa12.98□□□□□ -0.33
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ptger3P30557 365 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.5 ms